装置装着後や調整直後に歯の動きによる痛み・圧迫感が生じることがあります。通常1〜2週間程度で軽減し慣れていきます。
また、口唇や頬粘膜に装置が擦れて潰瘍ができる場合がありますが、こちらも徐々になじんできて、できにくくなります。

歯の移動に伴い一時的に歯が緩むように感じることがあります。
ごくまれに歯根が短くなる「歯根吸収」が進行する場合があり、重度の場合は治療方法の変更や中止を検討することがあります。また、歯の移動に伴い歯ぐきが引っ張られ下がったようになること（歯肉退縮）や歯と歯の間の歯茎が下がって空隙が見えてくること（ブラックトライアングル）など歯肉形態が変化することがあります。

装置周辺は清掃が難しく、虫歯や歯周病、歯の白濁（ホワイトスポット）が発生しやすくなります。適切なブラッシングと定期的なメインテナンスが不可欠です。また歯が動くと見えなかったむし歯が見えるようになることもあります。

まれに歯髄壊死や歯の変色が起こる場合があります。外傷歴のある歯や根管治療済みの歯はリスクが高くなる傾向があります。また、そのような歯は歯が骨と癒着し、歯が動かないことがあります。その場合、外科的処置を併用するか、治療方針を変更する場合がございます。

咬み合わせが変化していくため、治療中や治療後に、顎関節の痛み・雑音・開口障害などが生じることがあります。症状に応じて顎関節治療や装置の調整を行います。

矯正終了後に保定装置（リテーナー）を指示通り使用しない場合、歯並びが後戻りする可能性があります。保定期間の遵守が重要です。

金属アレルギーや樹脂（レジン）アレルギーをお持ちの方は、装置に含まれる成分で口内炎・発疹・かゆみなどが起こることがあります。異変を感じた場合は速やかにご連絡ください。

矯正用アンカースクリュー（TAD）挿入や便宜抜歯などを行う際、腫れ・痛み・出血・感染が生じることがあります。
スクリューは骨結合しない場合や炎症が続く場合に撤去・再設置が必要になることがあります。

歯の移動速度は個人差が大きく、想定より治療期間が長引いたり追加費用が発生したりすることがあります。また、装置の使用状況、顎間ゴムの使用状況、定期的な通院等、矯正歯科治療には患者様の努力・協力が必要不可欠です。それらが治療結果や治療期間に影響します。
う蝕・歯周病治療や装置破損の修理など、矯正以外の処置費用が別途必要となる場合があります。

歯を削ることで歯の形を修正したり、噛み合わせの微調整を行う可能性があります。

顎の成長発育により噛み合わせや歯並びが変化する可能性があります。
治療後に親知らずの萌出などの影響で凸凹が生じる可能性があります。また、加齢や歯周病等により歯を支えている骨が痩せると噛み合わせや歯並びが変化することがあります。

装置を外す際、エナメル質に微小な亀裂が入る可能性や、被せ物（補綴物）の一部が破損する可能性があります。

装置を外した後、治療により変化した噛み合わせに合わせて被せ物（補綴物）やむし歯の治療（修復物）などをやり直す可能性があります。

予期しない成長による変化が生じた場合、治療に伴うリスクが大きくなり歯に負担がかかることが予想される場合は、治療開始前の計画を変更することがあります。

矯正歯科治療は、一度始めると元の状態に戻すことは難しくなります。